Quán triệt sâu sắc các nghị quyết của Đảng, Quân ủy Trung ương về đổi mới toàn diện công tác giáo dục và đào tạo trong tình hình mới cũng như các đề án, kế hoạch, chương trình đổi mới công tác đào tạo, Đảng ủy, Ban Giám đốc Học viện Quân y đã lãnh đạo, triển khai thực hiện tốt các nghị quyết về công tác giáo dục và đào tạo, trong đó tập trung hoàn thành xây dựng, triển khai chương trình đào tạo đại học (bác sĩ y khoa, dược sĩ), sau đại học theo hướng tích hợp dựa trên năng lực và chuẩn đầu ra.
Học viện đã mở 4 ngành đào tạo trình độ thạc sĩ; 8 ngành đào tạo trình độ tiến sĩ; ngành đào tạo bác sĩ y học dự phòng; đồng thời rà soát, bổ sung, hoàn thiện nội dung, chương trình đào tạo nội khoa, ngoại khoa dã chiến, diễn tập và thực tập ở các đơn vị...
Bên cạnh đó, cập nhật chương trình đào tạo tiếng Anh cho bác sĩ đa khoa quân y; mở các lớp đào tạo văn bằng 2, lớp tiếng Anh chứng chỉ quốc tế và VSTEP; công tác quản lý đào tạo, quản lý học viên theo hướng tăng cường ứng dụng công nghệ thông tin; rà soát, bổ sung xây dựng đồng bộ các quy chế, quy định đào tạo và quản lý; triển khai hiệu quả hoạt động của các trung tâm, phòng thực nghiệm, la-bô; biên soạn, bổ sung sách, giáo trình, tài liệu mới để nâng cao chất lượng đào tạo.

Công tác kiểm tra, giám sát của Đảng ủy Học viện Quân y nhiệm kỳ 2020-2025 được tiến hành đúng nguyên tắc, đạt chất lượng tốt
Học viện Quân y cũng đã triển khai có hiệu quả nhiệm vụ nghiên cứu khoa học với nhiều hướng ở từng cơ quan, đơn vị và từng nhóm nghiên cứu, trong đó có nhiều đề tài nghiên cứu cấp Nhà nước, cấp Bộ được ứng dụng, triển khai thành công.
Phong trào nghiên cứu khoa học được đẩy mạnh, nhiều công trình, sản phẩm, sáng kiến, đề tài đạt giải cao, được cấp bằng độc quyền sáng chế, giải pháp hữu ích, có nhiều sáng kiến hỗ trợ tích cực cho công tác đào tạo, chẩn đoán, điều trị.
Đáng chú ý, hoạt động công bố các công trình nghiên cứu khoa học trên các tạp chí chuyên ngành uy tín trong nước và nước ngoài thuộc hệ thống ISI/Scopus được quan tâm đẩy mạnh (tăng 21,4% so với chỉ tiêu đề ra)…
Không chỉ nhiệm vụ đào tạo và nghiên cứu khoa học được hoàn thành tốt, trong nhiệm kỳ qua, công tác khám, chữa bệnh được Học viện chú trọng bằng việc tăng cường giáo dục nâng cao y đức, tinh thần trách nhiệm, thái độ phục vụ của đội ngũ cán bộ, nhân viên y tế.
Học viện mở các lớp tập huấn, trao đổi chuyên môn, cử cán bộ, bác sĩ, điều dưỡng đi đào tạo kỹ thuật mới trong và ngoài nước để nâng cao trình độ, đồng thời chủ động rà soát, hoàn thiện xây dựng các quy trình về xét nghiệm, thủ thuật, kỹ thuật, phẫu thuật, chẩn đoán và điều trị.
Nhiều kỹ thuật mới, kỹ thuật tiên tiến, hiện đại được ứng dụng, góp phần nâng cao chất lượng đào tạo, thực hiện chương trình quân-dân y kết hợp, hỗ trợ các bệnh viện tuyến dưới; kết hợp chặt chẽ giữa y học cổ truyền và y học hiện đại trong công tác tư vấn, chăm sóc sức khỏe cho bộ đội và nhân dân… Nhờ đó, các chỉ tiêu khám, cấp cứu, thu dung điều trị đều vượt so với chỉ tiêu Nghị quyết.
Trong đại dịch Covid-19, với tinh thần “chống dịch như chống giặc”, đội ngũ y, bác sĩ và cán bộ, nhân viên, học viên Học viện Quân y đã cùng với các lực lượng toàn quân không quản ngại gian khổ, hiểm nguy đi vào tâm dịch, sẵn sàng nhận rủi ro về mình để phục vụ, chăm sóc, cứu chữa người dân trong các vùng dịch hoành hành.
Bám sát các chiến lược, chương trình phát triển giáo dục đào tạo, trong nhiệm kỳ 2025-2030, Đảng ủy, Ban Giám đốc Học viện tiếp tục lãnh đạo tập trung đổi mới, nâng cao chất lượng công tác đào tạo với phương châm “Chất lượng đào tạo của nhà trường là khả năng sẵn sàng chiến đấu của đơn vị”; xây dựng Học viện thông minh, hiện đại, phấn đấu đến năm 2030 cơ bản đủ tiêu chí của trường đại học định hướng nghiên cứu, thuộc nhóm hàng đầu quốc gia về khối ngành sức khỏe.
Nhiệm kỳ 2025-2030, Học viện Quân y tiếp tục tập trung đổi mới, nâng cao chất lượng công tác đào tạo với phương châm “Chất lượng đào tạo của nhà trường là khả năng sẵn sàng chiến đấu của đơn vị”.
Học viện tiếp tục đổi mới phương pháp dạy và học theo hướng hiện đại; chú trọng xây dựng các chương trình đào tạo y dược học quân sự; đánh giá người học theo hướng phát triển phẩm chất, năng lực; có tư duy đổi mới sáng tạo; bảo đảm dạy thực chất, học thực chất, đánh giá thực chất kết quả học tập của học viên; đầu tư cơ sở vật chất, hạ tầng, nâng cấp, ứng dụng công nghệ thông tin, chuyển đổi số đáp ứng yêu cầu đổi mới công tác giáo dục và đào tạo.
Học viện sẽ tập trung hoàn thành tốt nhiệm vụ khám bệnh, thu dung, cấp cứu và điều trị hướng tới mục tiêu chăm sóc sức khỏe toàn diện; xây dựng mô hình bệnh viện thông minh, bệnh viện trường đại học hiện đại, trở thành trung tâm khám, chữa bệnh mẫu mực, tiên tiến, đáp ứng yêu cầu bảo vệ, chăm sóc sức khỏe của bộ đội và nhân dân.
Mặt khác, đẩy mạnh nghiên cứu khoa học, đổi mới sáng tạo, ứng dụng công nghệ thông tin, chuyển đổi số; trọng tâm nghiên cứu các lĩnh vực y dược học quân sự, công nghệ, sản phẩm chiến lược về y dược.
Phấn đấu có từ 7 đến 12 đề tài cấp quốc gia; từ 35 đến 40 đề tài cấp bộ và tương đương, hằng năm có hơn 120 bài báo được công bố trên các tạp chí quốc tế ISI/Scopus; số hóa 100% giáo trình, tài liệu phục vụ công tác đào tạo… góp phần xây dựng Quân đội nhân dân Việt Nam cách mạng, chính quy, tinh nhuệ, hiện đại, đáp ứng yêu cầu nhiệm vụ bảo vệ Tổ quốc trong tình hình mới.