Lễ khai mạc diễn ra ngắn gọn, trang trọng với sự tham dự của đại diện Trung ương Đoàn, Bộ Văn hóa, Thể thao và Du lịch, Ủy ban nhân dân Thành phố Hồ Chí Minh, Liên đoàn Bóng đá Việt Nam, đại diện các đơn vị tổ chức và đồng hành cùng giải đấu.
Ban tổ chức giải đã dành những phần quà ý nghĩa tặng cho các cầu thủ là người dân tộc thiểu số đang khoác áo các đội bóng tham dự Vòng chung kết. Đây là hoạt động mang tính nhân văn, nhằm động viên và khích lệ tinh thần các em nhỏ có hoàn cảnh đặc biệt.

Ngay sau lễ khai mạc, bảng A bước vào lượt trận đầu tiên. U13 Becamex Bình Dương để U13 Bình Dương gỡ hòa 2-2 trong trận cầu nội bộ giàu kịch tính. Trong khi đó, U13 Phú Thọ cũng giành 1 điểm quan trọng sau pha lập công muộn, khép lại trận đấu với U13 Hà Nội với tỷ số 1-1.
Trước đó, loạt trận buổi sáng ở các bảng B và C đã chứng kiến những kết quả đầy bất ngờ. Tại bảng B, U13 Đà Nẵng giành chiến thắng sát nút 1-0 trước U13 Huế, trong khi U13 VES Bà Rịa-Vũng Tàu vượt qua U13 Haduwaco Hải Dương với cùng tỷ số.
Ở bảng C, U13 Hồng Lĩnh Hà Tĩnh giành trọn 3 điểm sau khi đánh bại U13 Navy Phú Nhuận (Thành phố Hồ Chí Minh) 2-0, còn U13 Quảng Nam và U13 Nam Định chia điểm với kết quả hòa 1-1.
Vòng bảng sẽ tiếp tục diễn ra với 8 trận đấu ở 4 bảng vào ngày 5/7.
Song song với các trận đấu, ngày 4/7, Ban tổ chức sẽ triển khai hai chương trình đồng hành cùng Công ty Yamaha Motor Việt Nam và câu lạc bộ Júbilo Iwata (Nhật Bản).
Buổi sáng, các cầu thủ nhí sẽ tham gia chương trình “U13 Yamaha Cup học đá bóng cùng huấn luyện viên Júbilo Iwata” tại sân Gò Đậu. Tại đây, những gương mặt xuất sắc nhất sẽ được lựa chọn vào vòng tuyển chọn tiếp theo, hướng tới cơ hội sang Nhật Bản tham quan, tập huấn vào tháng 10 tới.
Buổi chiều cùng ngày sẽ diễn ra “Hội thảo giao lưu chia sẻ kinh nghiệm công tác đào tạo, huấn luyện bóng đá U13 Yamaha Cup và Júbilo Iwata” dành cho huấn luyện viên các đội bóng tham dự. Đây là dịp để các nhà chuyên môn trao đổi, học hỏi mô hình đào tạo bóng đá trẻ tiên tiến, hướng tới sự phát triển bền vững của bóng đá thiếu niên Việt Nam.