Chương trình kiểm tra nhằm đánh giá các chỉ tiêu lý-hóa-sinh của nước hồ, từ đó đưa ra các khuyến nghị phục vụ công tác quản lý, vận hành hồ chứa và bảo đảm an toàn nguồn nước tưới cho hàng trăm nghìn héc-ta đất nông nghiệp thuộc các tỉnh Tây Ninh, Bình Dương, Bình Phước và Thành phố Hồ Chí Minh.
Theo đại diện Viện Kỹ thuật Biển, việc kiểm tra được thực hiện tại nhiều vị trí khác nhau quanh lòng hồ, bao gồm các điểm gần cửa xả, khu vực tiếp nhận dòng chảy từ sông Sài Gòn và các vùng ven hồ có hoạt động sản xuất nông nghiệp, thủy sản.
Các mẫu nước sẽ được phân tích nhằm xác định các chỉ tiêu như độ pH, độ đục, hàm lượng amoni, nitrat, kim loại nặng, vi sinh vật và chất hữu cơ.

Kết quả phân tích sẽ được tổng hợp và báo cáo về Bộ Nông nghiệp và Môi trường, đồng thời cung cấp cho các cơ quan quản lý địa phương để phối hợp triển khai các biện pháp bảo vệ nguồn nước, bảo đảm phục vụ tốt cho sản xuất và sinh hoạt.
Việc kiểm tra chất lượng nước hồ Dầu Tiếng nằm trong chiến lược tăng cường giám sát môi trường nước tại các hồ chứa lớn trong bối cảnh biến đổi khí hậu và áp lực gia tăng từ hoạt động phát triển kinh tế-xã hội.