Trong buổi sáng 2/10, Đại hội tiếp tục tiến hành thảo luận; sau đó nghe đại diện Đoàn Chủ tịch kết luận nội dung thảo luận, đóng góp ý kiến vào dự thảo các văn kiện Trung ương trình Đại hội XIV của Đảng.
Đại hội đã thông qua Báo cáo chính trị, Báo cáo kiểm điểm của Quân ủy Trung ương khóa XI, nhiệm kỳ 2020 - 2025; thảo luận các văn kiện của Quân ủy Trung ương; đóng góp ý kiến vào dự thảo các văn kiện của Trung ương; bầu 48 đồng chí, cùng 16 đại biểu đương nhiên đang công tác trong Quân đội tham dự Đại hội đại biểu toàn quốc lần thứ XIV của Đảng.
Đại hội đã thông qua Nghị quyết Đại hội Đảng bộ Quân đội lần thứ XII, nhiệm kỳ 2025 - 2030, xác định 9 mục tiêu chủ yếu, 3 khâu đột phá, 10 nhiệm vụ và giải pháp lãnh đạo thực hiện nhiệm vụ quân sự, quốc phòng, cùng 7 nhiệm vụ, giải pháp xây dựng Đảng bộ Quân đội. Nghị quyết xác định mục tiêu xây dựng Quân đội “cách mạng, chính quy, tinh nhuệ, hiện đại” sớm hơn một nhiệm kỳ so với Nghị quyết Đại hội đại biểu Đảng bộ Quân đội lần thứ XI đã đề ra.