Chương trình phối hợp công tác nhằm thực hiện tốt chức năng, nhiệm vụ của mỗi cơ quan, góp phần nâng cao đời sống vật chất và tinh thần cho đồng bào dân tộc thiểu số (DTTS); theo dõi và phản ánh kịp thời, đầy đủ và toàn diện về tình hình kinh tế - xã hội vùng DTTS; phối hợp thông qua các hoạt động cụ thể nhằm tham mưu, đề xuất chủ trương, chính sách với Đảng, Nhà nước để góp phần giải quyết những khó khăn của đồng bào DTTS, vận động viện trợ cho đồng bào DTTS phát triển kinh tế - xã hội, xóa đói, giảm nghèo bền vững.
